دبیران:

مهمترین سمت ثابت شورای عالی امنیت ملی مسئولیت دبیرخانه آن است که با انتخاب مستقیم رئیس‌جمهور تعیین می‌شود. با اینکه دبیر حق رای ندارد، اما مطابق روال مرسوم در اغلب موارد پس از انتخاب دبیر از سوی رئیس‌جمهور، همزمان آیت‌الله خامنه‌ای رهبر ایران، وی را به نمایندگی رهبری در شورا نیز منصوب می‌کند تا حق رای داشته‌باشد.

 دبیر شورا، مسئولیت اداره دبیرخانه و نظارت بر اجرای صحیح تصمیمات و مصوبات شورا و امور اداری و اجرایی شورا را بر عهده دارد.

در حال حاضر علی شمخانی دبیر فعلی شورای عالی امنیت ملی می‌باشد که در تاریخ ۱۹ شهریور ۱۳۹۲ طی حکمی از سوی حسن روحانی رئیس‌جمهور، به این سمت منصوب شد.

1- حسن روحانی: 20 مهر 1368 – 24 مرداد 1384

2- علی لاریجانی: 24 مرداد 1384 – 28 مهر 1386

3- سعید جلیلی: 28 مهر 1386 – 19 شهریور 1392

علی شمخانی: 19 شهریور 1392 – هم اکنون