صفیه مدرس در مهر ماه سال 1359 با شهید مهدی باکری فرمانده لشگر 31 عاشورا ازدواج کرد.
وی نحوه ازدواج با شهید باکری را این گونه عنوان می کند :
خواستگاری ما با شروع جنگ تحمیلی در مهرماه سال 59 بود که توسط یکی از دوستان مشترکمان به نام رسول نادری که خودش رئیس شهربانی ارومیه و دوست مهدی بود و همسرش نیز در جلسات مذهبی و قرآن با من دوست بود، شکل گرفت.