محمد ایوبی داستان نویس بود. وی از معدود نویسندگان دهه چهل بود که بعد از انقلاب اسلامی هم ماند. او از اعضای قدیمی کانون نویسندگان بود. رمان های راه شیری، سفر تا سرطان مغول، سه گانه آواز طولانی جنوب و مجموعه داستان مراثی بی پایان از آثار اوست. او سردبیر مجله اینترنتی - ادبی خزه بود که گاه به گاه به روز می شود. از آثار او می توان از "گزیده اشعار نیما یوشیج"، سه گانه رمان "آواز طولانی جنوب" ("غمزه مردگان"، "سفر سقوط" و "زیتون تلخ،خرمای گس")، داستان بلند "راه شیری"، رمان های "صورتک های تسلیم"، "زیر چتر شیطان" و "روز گراز" و مجموعه داستان های "مراثی بی پایان"، "پایی برای دویدن" و "شکفتن سنگ" نام برد. رمان "صورتک های تسلیم" او در سال جاری از نامزدهای دریافت جایزه جلال آل احمد است.
ایوبی در دهه هفتاد مدتی مسئول صفحه ادبی روزنامه سلام بود که مجموعه مقالات او در آن روزنامه، بعدها در قالب کتاب "جان شکر" گردآوری و منتشر شد. آقای ایوبی مجموعه داستان "جنوب سوخته" و رمان "طیف باطل" را نیز پیش از انقلاب سال ۱۳۵۷ ایران نوشته بود که به گفته خود او "هر دو به دست ممیزان دوران به مقوا بدل گشته اند". رمان "با خلخال های طلایم خاکم کنید" نوشته محمد ایوبی نیز در سال های اخیر موفق به گرفتن مجوز از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی نشد و نهایتاً در وب سایت رادیو زمانه منتشر شد. دو رمان "مرد نشویش همیشه" و "آب بازی" نوشته محمد ایوبی زیر چاپ هستند که به زودی منتشر خواهند شد.